高通量测序(高通量测序染色体异常检测)

什么是普通的基因测序,它和高通量测序有什么区别吗

“普通的银颂基因测序”应该是指“常规DNA测序”吧，是用Sanger法（也就是双脱氧法）进行测序的方法，目前非常普遍的是直接用ABI 3730xl进行的自动测序，基本上可以做到600bp-800bp的读长。

高通量测序的概念其实是一个相对的概念，在2000年的时候，3700、MegaBace等仪器上的测序也是高通量测序，是相对手工测序或者跑平板胶来说的。锋没郑

不过到2005年以后，高通量测序就改指第二代测序（Next generation sequencing），454、Solexa(后改为Illumina）和SOLiD等第二代测序，比3730等第一代测序的通量提高了成千上万倍，甚至上亿倍，所以称为高通量测序。

NGS的特点主要有：

1、通量高。一个RUN能产生500Mb-600Gb的数据量。

2、读长相对较短。454(约400-500bp)，llumina（100-250bp），SOLiD（75-100）。

3、单位数据的成本非常低。现在很多项目测序的察基费用。已经非常低。生物信息分析成本变得更为重要了。

高通量测序技术及原理介绍

高通量测序技术及原理介绍如下：

1.什么是高通量测序

高通量测序技术也被称作二代测序技术（Next Generation Sequencing, NGS），乎冲这是相对一代测序技术（Sanger Sequencing）而言的，同时由于高通量测序的出现使得我们能对一个物种的基因组和转录组进行全面、细致的分析成为可能，所以又被称为深度测序(deep sequencing)。

高通量测序技术以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志，通过读取多个短DN**段，拼接成完整的序列信息。与一代测序Sanger法相比，高通量测序技术在处理大规模样品时具有显著的优势，在测序速度及测序通量上具有无可取代的地位，是目前组学研究中的核心技术。

2.原理

将基因组 DN**断化，然后克隆到质粒载体上，再转化大肠杆菌。对于每个测序反应，挑出单克隆，并纯化质粒 DNA。每个每个循环测序反应含有所有四种脱氧核苷酸三磷酸(dNTP)使之扩增，并混入**的一种不同的双脱氧核苷三磷酸(ddNTP)使之终止。由于ddNTP的2’和3’都不含羟基，其在DNA的合成过程中不能形成迟岩磷酸二酯键。

因此可以用来中断DNA合成反应，在4个DNA合成反应体系中分别加入一定比例带有放射性同位素标记的ddNTP（分为：ddATP,ddCTP,ddGTP和ddTTP），使延长的寡聚核苷酸选择性地在G、A、T或C处终止，并产生荧光标记。

最终得到一岁旦歼组长几百至几千碱基的链终止产物，它们具有共同的起始点，但终止在不同的的核苷酸上。通过凝胶电泳和放射自显影后可以根据电泳带的位置确定待测分子的DNA序列。

高通量基因测序是什么意思

高通量是相对于第一代测序的，第一代测序只能一次测1个样品的1段序列，产生的数据量相对来说很小，而高通量测序一次能够产生的数据量在几十G上百G，可以一次测很多的样本。

在2000年的时候，3700、MegaBace等仪器上的测序也是高通量测序，是相对手工测序或者跑平板胶来说的。

不过到2005年以后，高通量测序就改指第二代测序（Next generation sequencing），454、Solexa(后改为Illumina）和SOLiD等第二代测序，比3730等第一代测序的通量提高了成千上万倍，甚至上亿倍，所以称为高通量测序携李。

原理：

测序纤野方案建立在双脱氧测序法(Sanger等，1977)的基础上。为了从每一克隆插入片段两端成对地进行测序，每一个质粒模板DNA板应配备两个384孔循环测序反应板。测序辩竖迟反应采用Big Dye Terminator chemistry version 3．1(AppliedBiosystems)和标准M13或常用正向引物和反向引物。测序反应通过BiomekFX(Beckman)移液操作工作站建立。

机械臂负责等分模板试样，起与反应液混合的作用，反应液含有双脱氧核苷酸、荧光标记的核苷酸、TaqDNA聚合酶、序列引物和缓冲液。模板和反应板有条形码，且在BiomekFX移液操作工作站上有条形码读取器跟踪，确保模板和反应液转移中没有错误。30～40线性扩增步骤连续循环在MJResearchTetrads或9700热循环仪(Ap—pliedBiosystems)中进行。

参考资料来源：百度百科-基因组高通量测序

核酸测序属于中通量还是高通量

对于目前来讲，随着科技的发展，核酸的发展已经经历了几个时期，具体如下：

1、一代测序：一代测序中主要是对DNA来讲的，比如sanger测序，主要针对pcr产物、TA克隆、培养的质粒菌液等，一代测序属于低通量测序。

2、二代测序：对于DNA来讲，目前的主要应用为tn5转座酶的文库构建，还有用来研究DNA与蛋白研究互作的CHIP-seq，以及wes或者wgs测序等。

对于RNA的建库竖辩就很多了，做兄比如mRNA-seq，lncRNA-seq，circRNA-seq，miRNA-seq，或者是全转录组测序等等。

还有就是目前比较研究比较火的，单细胞测序，以及单细胞中的各种延伸测序等。

这些都是属于高通量测序。

3、目前还有的就是第三代测序，比如HI-C测序等等，这些也是属于高通量测序。

对于通量的理解，其实就是一次实验能够检测的基因数量，比余胡缺如现在的基因芯片，其实也是属于高通量检测，而我们平时做的qPCR检测这些是属于低通量的。

目前的测序中的主要特点，通量越来越大，读长越来越长，价格越来越低的趋势发展。

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